小檜山 篤志
准教授
小檜山 篤志
Atsuishi
Kobiyama

主な研究テーマ

渦鞭毛藻の生理生態に関する研究

渦鞭毛藻(うずべんもうそう)と呼ばれる植物プランクトンには,光合成を行うもの,餌を食べるもの,昼は泳いで夜は寝てしまうもの,サンゴに共生するものなど,様々な種が含まれます.また,ユニークな生理生態を持つものが存在し,そのメカニズムが解明されていないものが未だ多く残されています.私はその未解明で面白い生命現象を,培養実験や分子生物学的な実験を用いて詳細な機構を明らかにしようとしています.以下の事などについて研究を行っています.
  • どうやって広い海で相手を見つけて有性生殖を行うの?
  • どうやって環境の変化を感じとって反応するの?
  • 渦鞭毛藻と周囲に存在する細菌との関係は?

担当科目

1年次生対象海洋生命科学概論(必修:分担)
2年次生対象微生物学(必修)微生物は生態系において重要なだけではなく,人間生活にも密接に関係しています.この講義では微生物に関する基本的な内容を学んでもらいます.
3年次生対象海洋生命科学実験III(必修:分担)微生物の基本的な取り扱いとDNAの取り扱いについて学んでもらいます.
4年次生対象海洋生命科学演習
卒業論文
その他

経歴?業績等

主な経歴

  • 東京水産大学(現東京海洋大学)卒業
  • 東京大学大学院農学生命科学研究科修了
  • 博狗体育在线_狗博体育直播【官方授权网站】@水産学部助手
  • 博狗体育在线_狗博体育直播【官方授权网站】@海洋生命科学部准教授

主な業績

著書
  • Reza MS, Kobiyama A, Rashid J, Yamada Y, Ikeda Y, Ikeda D, Mizusawa N, Yanagisawa S, Ikeo K, Sato S, Ogata T, Kudo T, Kaga S, Watanabe S, Naiki K, Kaga Y, Segawa S, Mineta K, Bajic V, Gojobori T, Watabe S. Metagenomic Methods: From Seawater to the Database. Marine Metagenomics. Springer, Singapore, (2019): 3-16.
  • Kudo T, Reza MS, Kobiyama A, Rashid J, Yamada Y, Ikeda Y, Ikeda D, Mizusawa N, Yanagisawa S, Ikeo K, Sato S, Ogata T, Kaga S, Watanabe S, Naiki K, Kaga Y, Segawa S, Mineta K, Bajic V, Gojobori T, Watabe S. Marine Metagenomic Sequence Counts of Reads Assigned to Taxa Consistently Proportionate to Read Counts Obtained for per g of Seawater Sample." Marine Metagenomics. Springer, Singapore, (2019): 183-188.

論文
  • Niwa K, Kobiyama A. 2019. Development of a new cultivar with high yield and high-temperature tolerance by crossbreeding of Undaria pinnatifida (Laminariales, Phaeophyta). Aquaculture 506: 30-34.
  • Niwa K, Abe T,i Kobiyama A. 2018. Possibility of polyploidy breeding using cryptic species in the marine crop Pyropia yezoensis (Bangiales, Rhodophyta). Journal of Applied Phycology 30.2 (2018): 1197-1205.
  • Kobiyama A, Ikeo K, Reza MS, Rashid J, Yamada Y, Ikeda Y, Ikeda D, Mizusawa N, Ikeo K, Sato S, Ogata T, Jimbo M, Kudo T, Kaga S, Watanabe S, Naiki K, Kaga Y, Mineta K, Bajic V, Gojobori T, Watabe S. 2018. Metagenome-based diversity analyses suggest a strong locality signal for bacterial communities associated with oyster aquaculture farms in Ofunato Bay. Gene, 655: 149-154. 
  • Reza MS, Kobiyama A, Yamada Y, Ikeda, Y Ikeda, D Mizusawa N, Ikeo K, Sato S, Ogata T, Jimbo M, Kudo T, Kaga S, Watanabe, S, Naiki, K, Kaga, Y, Mineta, K, Bajic, V, Gojobori, T, Watabe, S 2018. Taxonomic profiles in metagenomic analyses of free-living microbial communities in the Ofunato Bay. Gene, 655: 192-200. 
  • Rashid J, Kobiyama A, Reza S, Yamada Y, Ikeda Y, Ikeda D, Mizusawa N, Ikeo K, Sato S, Ogata T, Kudo T, Kaga S, Watanabe S, Naiki K, Kaga Y, Mineta K, Bajic V, Gojobori T, Watabe S. 2018. Seasonal changes in the communities of photosynthetic picoeukaryotes in Ofunato Bay as revealed by shotgun metagenomic sequencing. Gene, 665: 127 - 132.
  • Kobiyama A, Tanaka S, Kaneko Y, Lim PT, Ogata T 2010. Temperature Tolerance and Expression of Heat Shock Protein 70 in the Toxic Dinoflagellate Alexandrium tamarense(Dinophyceae) Harmful Algae, 9: 180 - 185.
  • Iida S, Kobiyama A, Ogata T, Murakami A. 2009. Identification of transcribed and persistent variants of the psbA gene carried by plastid minicircles in a dinoflagellate. Current genetics 55: 583-591.
  • Kobiyama A, Ikeda Y, Koike K, Ogata T. 2007. Isolation of a differentially expressed gene in separate mating-types of the dinoflagellate Alexandrium tamarense. European Journal of Phycology, 42: 183 - 190.