主な研究テーマ

創薬において、天然由来の化合物は医薬リード化合物として非常に重要な役割を担っています。これまでに承認された薬のうち約半数は天然化合物またはその誘導体であることが知られています。天然資源から単離された化合物は、ユニークな化学構造や生物活性をもつものも多く、さらなる医薬品開発に向けて、新規天然化合物の探索が求められています。

様々な水生生物や海洋細菌の抽出物からの新規生物活性物質の探索

有用な生物活性を持つ新規天然化合物を探索するために、海洋資源の抽出物をスクリーニングし、活性のあったサンプルを各種クロマトグラフィー等に供して、活性を指標に化合物を単離します。得られた化合物は、核磁気共鳴装置 (NMR) や質量分析装置など各種光学分析機器によって解析し、化学構造を決定します。さらに、化合物の生合成経路や生物活性の作用機序の解析なども行います。

ゲノムマイニング法による海洋細菌からの新規天然化合物の探索

海洋細菌のゲノム情報を解析し、ゲノム中に存在する二次代謝産物の生合成遺伝子の情報から、生産されうる天然化合物の大まかな構造を予測するゲノムマイニング的手法が活発に研究されています。この方法により、実際に長い時間をかけて天然化合物を単離、構造決定する前に、その細菌が生産しうる化合物の新規性をあらかじめ解析することが可能となりつつあります。この方法を用いて、海洋細菌からのユニークな構造を持つ新規天然化合物の探索を行っています。

1年次生対象
2年次生対象
3年次生対象	海洋生命科学実験III (分担)
	海洋生命工学 (分担)
4年次生対象	卒業論文
	海洋生命科学演習

経歴?業績等

主な経歴

• 博士（農学、東京大学）
• 日本学術振興会特別研究員
• Alexander von Humboldt postdoctoral fellow (ボン大学)
• チューリッヒ工科大学博士研究員
• 国立研究開発法人産業技術総合研究所研究員

主な業績

著書

論文

• “Evolution of combinatorial diversity in trans-acyltransferase polyketide synthase assembly lines across bacteria”, Eric J. N. Helfrich*, Reiko Ueoka*, Marc G. Chevrette*, Franziska Hemmerling, Xiaowen Lu, Stefan Leopold-Messer, Hannah A. Minas, Adrien Y. Burch, Steven E. Lindow, J?rn Piel, Marnix H. Medema, Nat. Commun., 12:1422, 2021.
• “Genome mining of oxidation modules in trans-acyltransferase polyketide synthases reveals a culturable source for lobatamides”, Reiko Ueoka*, Roy A. Meoded*, Alejandro Gran-Scheuch, Agneya Bhushan, Marco W. Fraaije, J?rn Piel, Angew. Chem. Int. Ed., vol.59, pp7761-7765, 2020.
• “Automated structure prediction of trans-acyltransferase polyketide synthase products”, Eric J. N. Helfrich*, Reiko Ueoka*, Alon Dolev*, Michael Rust, Roy A. Meoded, Agneya Bhushan, Gianmaria Califano, Rodrigo Costa, Muriel Gugger, Christoph Steinbeck, Pablo Moreno, J?rn Piel, Nat. Chem. Biol., vol.8, pp813-821, 2019.
• “Genome-Based Identification of a Plant-Associated Marine Bacterium as a Rich Natural Product Source”, Reiko Ueoka, Agneya Bhushan, Silke I. Probst, Walter M. Bray, R. Scott Lockey, Roger G. Linington, J?rn Piel, Angew. Chem. Int. Ed., vol.57, pp.14519-14523, 2018.
• “Toblerols, Cyclopropanol-Containing Modulators of Methylobacterial Antibiosis Generated by an Unusual Polyketide Synthase”, Reiko Ueoka, Miriam Bortfeld-Miller, Brandon I. Morinaka, Julia A. Vorholt, J?rn Piel, Angew. Chem. Int. Ed., vol.57, pp.977-981, 2018.
• “Cyanobacterial ent-Sterol-Like Natural Products from a Deviated Ubiquinone Pathway”, Philipp Moosmann*, Reiko Ueoka*, Laura Grauso, Alfonso Mangoni, Brandon I. Morinaka, Muriel Gugger, J?rn Piel, Angew. Chem. Int. Ed., vol.56, pp.4987-4990, 2017.
• “Metabolic and evolutionary origin of actin-binding polyketides from diverse organisms”, Reiko Ueoka*, Agustinus R. Uria*, Silke Reiter, Tetsushi Mori, Petra Karbaum, Eike E. Peters, Eric J. N. Helfrich, Brandon I. Morinaka, Muriel Gugger, Haruko Takeyama, Shigeki Matsunaga, J?rn Piel, Nat. Chem. Biol., vol.11, pp.705-714, 2015.
• “Yaku'amides A and B, Cytotoxic Linear Peptides Rich in Dehydroamino Acids from the Marine Sponge Ceratopsion sp.”, Reiko Ueoka, Yuji Ise, Susumu Ohtsuka, Shigeru Okada, Takao Yamori, Shigeki Matsunaga, J. Am. Chem. Soc., vol.132, pp.17692-17694, 2010.
• “Ophiodilactones A and B, Cytotoxic Tetrameric Phenylpropanoids, from the Ophiuroid Ophiocoma scolopendrina”, Reiko Ueoka, Toshihiko Fujita, Shigeki Matsunaga, J. Org. Chem., vol.74, pp.4396-4399, 2009.
• “Gracilioethers A-C, Antimalarial Metabolites from the Marine Sponge Agelas gracilis”, Reiko Ueoka, Yoichi Nakao, Shizuka Kawatsu, Junko Yaegashi, Yoshitsugu Matsumoto, Shigeki Matsunaga, Kazuo Furihata, Rob W. M. van Soest, Nobuhiro Fusetani, J. Org. Chem., vol.74, pp.4203-4207, 2009.