第1学年の後期に開講する「タンパク質化学」では、生体分子の概要、タンパク質の構造と分析法、酵素の性質や疾患との関わりなどの講義を行っている。さらに公共データベースや解析ソフトウェアを用いたタンパク質の立体構造解析を一人一人体得するコンピューター演習や、３Dビジュアルシステムを用いた映像講義も行っている。生化学（萬代単位）と分子遺伝学単位と協力して行う「分子医化学実習」では血清タンパク質の精製や分析、細胞分画法、血糖値やインスリン、遺伝子導入法と蛍光による細胞内局在の可視化などの実習を行っている。